수능 100% 전형이라면 내신이나 출결은 반영되지 않기 때문에 40일 미인정 결석이 직접적으로 정시 합격에 영향을 주진 않습니다.
다만 생활기록부에 기록은 남기 때문에 장학금·기숙사 선발 등에서 간접적으로 불이익이 있을 수는 있어요.
또 학교에서 시험 응시, 생활기록부 작성 등 관리 차원에서 문제 제기를 할 수도 있습니다.
결론적으로 대학 입학 자체엔 큰 지장은 없으니, 본인 공부 효율을 우선으로 두되 담임선생님과 최소한 상의는 해두는 게 안전합니다.
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